1982年，河姆渡遗址经中华人民共和国国务院公布为全国重点文物保护单位。1993年5月，河姆渡遗址博物馆落成开放，中共中央总书记、国家主席江泽民亲笔题写了馆名。为博物馆题词的党和国家领导人还有乔石、李岚清、雷洁琼、费孝通、卢嘉锡、程思远、李贵鲜、吴学谦、胡绳等。 河姆渡遗址博物馆由文物陈列馆和遗址公园两大部分组成。文物陈列馆紧邻遗址两侧。占地面积1600平方米，主体建筑面积3200平方米、建筑造型根据河姆渡7000年前“干栏式”建筑风格，“长脊。短檐、高床”的特点而设计依托456根桩基，构筑出高于一地面的架空层。人字形坡层面上耸起456根桩基．构筑出高于地面的架空层、人字形坡层面上耸起5－7组交错构件：象征着7000年前牌卯木作技术，再配以上红色波纹陶瓦、炒米黄毛面墙砖，房得自朴、野趣，并与河姆渡文化融为一体。序厅屋面形似展翅翱翔的鲲鹏、表现了河姆渡先民爱鸟、崇鸟的文化习俗。